澎湖南方四島國家公園於103年6月8日正式公告設立，是臺灣第九座國家公園。
澎湖南方的東吉嶼、西吉嶼、東嶼坪嶼、西嶼坪嶼合稱澎湖南方四島，位於約東經119°30'至119°41'，北緯23°14'至23°16'之間，除了面積較大的四個主要島嶼外，還包括周邊的頭巾、鐵砧、鐘仔、豬母礁、鋤頭嶼等附屬島礁。
未經過度開發的南方四島，無論是自然生態、地質景觀或人文史跡等資源，都維持著原始、低污染的天然樣貌，是觀察地質地形、與各種生態景觀的最佳區域。尤其附近海域覆蓋率極高的珊瑚礁更是汪洋中的珍貴資產。值得遊客前來體驗南方四島豐富多樣的生態環境。
東嶼坪嶼
東嶼坪嶼位於澎湖縣望安鄉南方偏東處，東經119°30'59.41''與北緯23°15'36.67''，面積 約0.48平方公里，海拔高度最高點約61公尺，為一玄武岩方山地形，島上的玄武岩柱狀節理發達，亦是澎湖群島中較為年輕的地層。
東嶼坪嶼由二大塊陸塊組成，故形成南、北二塊高地，北方陸塊早期多種植農作物因而有許多菜宅景觀，更有依地勢而闢建的梯田。在南山和北山中間地勢較為低窪 平坦的陸域則是東嶼坪嶼聚落集中的地區。聚落房舍除零星散落於南端，其主要座落於島嶼東邊臨海之狹長腹地，自港口與池府宮村廟起，由南往北延伸，聚落形式呈帶狀。
西嶼坪嶼
西嶼坪嶼位於東嶼坪嶼的西北方，東經119°30'26.60''，北緯23°16'12.14''，面積0.3477平方公里，海拔高度最高點約42公尺，是一略呈四角型的方山地形，因無法築港，僅只有一條碼頭位於島嶼的東南方。
因地形關係使得村落建築無法聚集於港口，因此選擇坡頂平坦處來定居發展，聚落位於島中央的平台上形成另一種特殊景觀與人文特色。
西嶼坪嶼的地勢東南方較高，四周大部份為海蝕崖及礫灘，從海上巡航較能清楚觀賞圍繞四周的海崖景觀。島上無高大遮蔽物，抬頭便能擁有整片藍天，偶見候鳥翱翔天空，氣氛十分悠閒。
東吉嶼
東吉嶼位於望安鄉的東南方，東經119°40'18.79''，北緯23°15'21.09''面積1.7712平方公里，海拔高度最高點約47公尺。
東吉嶼是南方四島中面積最大的方山島嶼，屬於南北兩端地勢較高、中間較低的馬鞍地形，南北兩端最高點約有50公尺，中間較低處為主要聚落集中區，現在村落的位置是早年的海底，因陸地逐漸抬升，村民逐漸往現在的港邊居住，坡度較陡處集中於島嶼南北兩側。
因島嶼位置靠近臺灣（臺南），航程僅約2小時30分，早年島上漁獲多送往臺南販售，島上日常生活用品亦購自臺南。
西吉嶼
西吉嶼位於東吉嶼西方，地形北高南低，屬於平坦的方山地形，坡度較陡處集中於島嶼北側。
位於東經119°36'56.23''，北緯23°14'56.40''其面積為0.89平方公里，海拔高度約23公尺。
北半部的海岸多為海崖，玄武岩景觀壯麗，底下則有多處的海蝕平台，每到冬季是澎湖南海各島中紫菜盛產主要區塊之一。東南側海岸多礁石，部分是由珊瑚及玄武岩碎屑組成的砂礫石灘地，過去聚落主要分布於煙墩山山腳下及島嶼的東南端延伸至海岸附近，港口也位於此。
西吉嶼是一處被遺落、遺忘的神秘之島，它雖與繁榮一時的東吉嶼僅有一海之隔，卻有著天壤之別的際遇。由於島上無碼頭可供船隻停靠，加上整體環境惡劣不利生活，西吉嶼於民國67年（西元1978年）由政府輔導遷村，民國81年（西元1992年）6月29日修正戶籍法廢除本籍登記，因此西吉嶼現今島上無人居住，僅剩過去聚落的遺跡，在大海中顯露格外荒涼蕭瑟的孤寂感。
附屬島嶼-頭巾
頭巾位於東經119°30'06.04''，北緯23°17'23.25''上，屬於火山碎屑岩層，岩礁區呈現黑色與黃色雙色分明的岩性，分別是黝黑的柱狀玄武岩與棕黃色的火山角礫岩。由北方海面遠望，這座小島的形狀有如古人的頭巾一般故得此名。
島上可見傾斜覆蓋在火山角礫岩上的玄武岩岩脈、受海潮侵蝕分離的海蝕柱，以及鑽蝕作用形成的壺穴等豐富地質景觀，目前已劃入澎湖南海玄武岩自然保留區。四立的岩礁與海潮帶來的漁獲，使頭巾於夏季時成為燕鷗繁殖棲息的天堂。
附屬島嶼-鐵砧
附屬島嶼-鐘仔
附屬島嶼-豬母礁
附屬島嶼-二塭
附屬島嶼-香爐
附屬島嶼-鋤頭嶼
附屬島嶼-柴垵塭
面積僅有0.11公頃，為西吉嶼北方由火山碎屑岩構成的小岩礁，常見島上有燕鷗棲息。
附屬島嶼-離塭仔
離塭仔(南塭仔、蜈蚣仔)位於東嶼坪嶼西南方，面積僅有0.25公頃，主要由火山碎屑岩所構成，其地勢平坦，最高點約2.8公尺。
